Σχεδόν εβδομήντα χρόνια αργότερα, η Σίφνια αρχαιολόγος Βαρβάρα Φιλιππάκη ξεκίνησε την πρώτη συστηματική έρευνα της ακρόπολης του Άγ. Ανδρέα υπό την αιγίδα της εν Αθήναις Αρχαιολογικής Εταιρείας. Από το 1997 έως σήμερα οι έρευνες συνεχίζονται υπό τη διεύθυνση της Δρ. Χριστίνας Τελεβάντου, αποκαλύπτοντας το μυκηναϊκό τείχος σε όλη την έκτασή του, αλλά και τον πυκνό πολεοδομικό ιστό των ιστορικών χρόνων (μέσα 8ου – 2ος αι. π.Χ.). Οι εργασίες ανάδειξης του χώρου στο διάστημα 2002-2008 προσέφεραν στη Σίφνο τον πρώτο οργανωμένο και επισκέψιμο αρχαιολογικό χώρο.